荷兰报告称NGS可作为一种转基因植物分子检测的新技术

作者: 2016-07-05 20:29 来源:战略情报研究部
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4月28日,荷兰遗传修饰委员会(COGEM)发布了一份报告[1],分析了“下一代测序”(NGS)技术在转基因植物环境风险评估中的可行性。基于文献和实验的结果,该报告认为NGS在转基因植物环境风险评估中具有重要的应用价值,并且该技术特别适用于转基因植物中插入的外源T-DNA和侧翼DNA序列的分子特征识别。

与Southern blot、PCR、染色体步移等传统转基因分子检测技术相比,NGS具有较多的优点:更为灵敏且成本相对低廉;能检测到其他传统技术不能发现的小片段插入;在有参考基因组序列的情况下,可对这些插入片段在基因组中位置进行定位;同时,NGS还可以直接确定插入片段和侧翼DNA的序列。

同时,该报告认为,若想要在转基因植物的NGS分析时获得更为灵敏和准确的结果,则需要考虑以下各种情况。比如,全基因组测序需要足够的测序深度和覆盖度;有一个较好的参考基因组;掌握转化载体序列;明确T-DNA序列及其物种来源是否清楚;利用PacBio等长片段测序技术对推断的插入位点进行验证等。              

   (杨艳萍)

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