2017年，战略咨询院紧扣国家高端智库建设要求和中科院“率先行动”计划部署，系统谋划未来5到10年发展，组织制定了以“十三五”为核心的战略咨询院中长期发展规划。通过召开战略咨询院中长期规划研讨会，组织100多位副高以上科研骨干和管理骨干进行研讨，理清了发展目标，明确了战略布局和重点，使规划编制成为统一认识，达成共识的过程。

        中长期规划明确，战略咨询院的目标定位是中国科学院学部发挥国家科学技术方面最高咨询机构作用的研究和支撑机构，是中国科学院率先建成国家高水平科技智库的重要载体和综合集成平台，是集成中国科学院院内外以及国内外优势力量建设的智库型创新研究院；明确了未来十年的战略目标是：成为国家倚重、社会信任、国际著名高水平科技智库；对事关国家发展全局和长远的重大决策提出有科学依据的咨询意见；为应对全球挑战和促进人类社会可持续发展提供重要科学思想支撑；成为全球科学技术和创新发展政策思想的引领者。

        战略咨询院着眼于促进科技发展，从科技规律出发前瞻思考世界科技发展走势；着眼于科技促进发展，从科学技术影响和作用的角度研究经济社会发展和国家安全的重大问题。围绕服务宏观决策、引领发展方向、发展智库理论方法不同层次的研究，凝练并形成了战略咨询院“十三五”重大突破、重点培育、前沿探索三个层次的科研任务布局，既着力促进重大产出，又着力厚实研究基础和后劲。

        明确战略咨询研究的重大突破是瞄准国家经济、社会发展和国家安全的重大战略和政策问题，有望在国家层面产生重大影响和重大贡献的研究任务，制定并实施了“十三五”期间的“世界科技前沿研判与中国重大科技突破前瞻研究”“面向全球竞争的高新产业源头技术研究”“百年强国资源环境关键瓶颈问题与对策研究”三个重大突破。

        明确战略咨询研究的重点培育方向是瞄准科技智库基础创新能力建设和理论方法研究，以及有望成为未来重大突破的方向，着力形成未来竞争优势，制定实施了“十三五”期间的“适应新科技革命与产业革命的科技体制变革研究”“大数据环境下可视化宏观决策支持平台”“学部思想库建设的专业化支撑体系”“高端科技智库的DIIS方法与理论体系”“决策咨询导向的科技智库综合集成系统”五个重点培育方向。

        明确战略咨询研究的前沿探索是前瞻性、储备性战略和政策研究，鼓励发挥想象力，鼓励原创，探索新的智库研究增长点，“十三五”期间通过院长青年基金项目持续遴选和支持一批前沿探索研究。